Dịch vụ hoàn thuế điện tử được Tổng cục Thuế triển khai từ ngày 4/8/2017. Sau hơn 3 năm triển khai, hệ thống hoàn thuế điện tử đã mở rộng cung cấp dịch vụ cho người nộp thuế tại 63 tỉnh, thành phố.
Tính từ ngày 1/1/2020 đến ngày 19/7/2020, tổng số doanh nghiệp tham gia hoàn thuế điện tử là 6.580 trên tổng số 6.834 doanh nghiệp được hoàn thuế (đạt 96,28%). Số hồ sơ tiếp nhận là 13.741 hồ sơ trên tổng số 14.088 hồ sơ, đạt tỷ lệ 97,54%. Tổng số hồ sơ hệ thống đã giải quyết hoàn là 9.996, với tổng số tiền đã giải quyết hoàn là hơn 57.422 tỷ đồng.
Cùng với việc giải quyết hoàn thuế bằng phương thức điện tử, Tổng cục Thuế cũng đã thí điểm triển khai hóa đơn điện tử có mã xác thực của cơ quan thuế tại TP. Hà Nội, TP. Hồ Chí Minh và TP. Đà Nẵng.
Tính từ thời điểm triển khai (tháng 9/2015) đến nay, có 255 doanh nghiệp đang tham gia thí điểm sử dụng hệ thống hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế. Có 765.181 hóa đơn đã được cấp mã, tổng doanh thu trên hóa đơn đã cấp mã là hơn 20.448 tỷ đồng, số thuế trên hóa đơn đã cấp mã là hơn 1.805 tỷ đồng./.