Nhưng dưới sự quan tâm và điều hành linh hoạt của Quốc hội, Chính phủ; sự chỉ đạo sát sao, quyết liệt của Bộ Tài chính; sự vào cuộc khẩn trương, ngay từ đầu năm của các cấp, các ngành, đặc biệt là cấp uỷ, chính quyền các địa phương, cùng với sự thống nhất tập trung, nỗ lực miệt mài không ngừng nghỉ của gần 4,5 vạn công chức, viên chức thuế cả nước để đổi mới tư duy, nhận thức, đổi mới phương pháp làm việc, mạnh dạn đề xuất những giải pháp, sáng kiến mới, nhiệm vụ chính trị năm 2013 của Tổng cục thuế đã đạt được những kết quả quan trọng. Thu NSNN đạt chỉ tiêu pháp lệnh Nhà nước giao. Các đề án chính sách thuế được ban hành đảm bảo kịp tiến độ đã đề ra. Công tác quản lý nội ngành, công tác phòng chống tham nhũng và thực hiện tiết kiệm chống lãng phí được chú trọng và có nhiều kết quả tốt, đảm bảo ngày càng phục vụ tốt hơn cho việc thực hiện nhiệm vụ chính trị của toàn hệ thống.
Bước sang năm 2014, mặc dù nền kinh tế - xã hội đất nước đang có những chuyển biến tích cực, nhưng khó khăn, thách thức vẫn chưa hết, thậm chí còn tiềm ẩn. Trong bối cảnh đó, Tổng cục thuế xác định 5 nhiệm vụ trọng tâm, xuyên suốt: Một là, thực hiện tốt nhiệm vụ thu NSNN năm 2014, đảm bảo vượt tối thiểu 5% dự toán pháp lệnh đã được Quốc hội, Chính phủ giao. Hai là, triển khai thực hiện kịp thời, hiệu quả các Nghị quyết của Chính phủ về những giải pháp chủ yếu nhằm ổn định kinh tế vĩ mô, kiểm soát lạm phát, tháo gỡ khó khăn cho sản xuất kinh doanh, phấn đấu đạt mức tăng tưởng cao hơn năm 2013. Ba là, tổ chức triển khai thực hiện tốt Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế GTGT, Luật Thuế TNDN, Luật Thuế TNCN và tiếp tục thực hiện tốt Luật sửa đổi, bổ sung Luật Quản lý thuế. Bốn là, đẩy mạnh tiến trình cải cách hiện đại hoá theo đúng lộ trình đã được phê duyệt. Năm là, thực hiện tốt chương trình phòng chống tham nhũng, thực hành tiết kiệm, chống lãng phí trong cơ quan thuế.